Conflans-Sainte-Honorine est, depuis le XIXe siècle, le principal carrefour des voies navigables du Nord de la France, au confluent de la Seine et de l’Oise. Le musée existe depuis une cinquantaine d'années. Rénové en 2015, il est installé dans le château du Prieuré. Il accueille visiteurs et chercheurs pour une découverte du monde de la voie d’eau.